Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rundc1Q0VDN7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rundc1Q0VDN7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms