Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TrioQ0KL02 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrioQ0KL02 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms