Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Znf541Q0GGX2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Znf541Q0GGX2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms