Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cass4Q08EC4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms