Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ssrp1Q08943 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ssrp1Q08943 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms