Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Calb2Q08331 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Calb2Q08331 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms