Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Col9a2Q07643 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Col9a2Q07643 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms