Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gdf3Q07104 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gdf3Q07104 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gdf3Q07104 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdf3Q07104 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gdf3Q07104 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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