Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah1bQ06985 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Siah1bQ06985 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms