Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox4Q06831 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms