Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cab39Q06138 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cab39Q06138 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cab39Q06138 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Cab39Q06138 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Cab39Q06138 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cab39Q06138 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cab39Q06138 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cab39Q06138 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Cab39Q06138 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cab39Q06138 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cab39Q06138 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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