Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Caprin2Q05A80 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms