Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Top1Q04750 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top1Q04750 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms