Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Emx2Q04744 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Emx2Q04744 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms