Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr5Q04683 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms