Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn6Q03958 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pfdn6Q03958 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms