Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aplp1Q03157 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aplp1Q03157 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms