Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddr1Q03146 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddr1Q03146 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms