Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjb5Q02739 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjb5Q02739 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms