Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh1Q02576 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms