Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxd1Q01822 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd1Q01822 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms