Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nme2Q01768 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nme2Q01768 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms