Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
EgfrQ01279 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EgfrQ01279 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms