Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrcdQ00LT2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms