Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rbp1Q00915 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rbp1Q00915 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms