Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfaQ00731 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms