Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx2Q00262 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms