Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb4P99026 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb4P99026 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms