Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smyd1P97443 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smyd1P97443 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms