Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps45P97390 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps45P97390 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms