Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb2P81069 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms