Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptprn2P80560 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptprn2P80560 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms