Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tp53bp1P70399 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tp53bp1P70399 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms