Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gfi1P70338 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms