Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx1P70314 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx1P70314 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms