Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux2P70298 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux2P70298 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux2P70298 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms