Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf6P70279 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf6P70279 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms