Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf5P70191 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf5P70191 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf5P70191 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms