Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Acta1P68134 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Acta1P68134 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms