Protein–RNA interactions for Protein: P63318

Prkcg, Protein kinase C gamma type, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcgP63318 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PrkcgP63318 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms