Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabrb3P63080 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms