Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx1P63006 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx1P63006 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx1P63006 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx1P63006 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx1P63006 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx1P63006 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx1P63006 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx1P63006 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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