Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tra2bP62996 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tra2bP62996 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms