Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rpl39P62892 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpl39P62892 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms