Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rab3cP62823 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms