Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsc22d1P62500 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsc22d1P62500 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms