Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd1P62315 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd1P62315 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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