Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga11P61622 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga11P61622 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga11P61622 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms