Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Stx1bP61264 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stx1bP61264 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms