Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf3P61205 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf3P61205 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf3P61205 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms